Описание тега gpt

Я запутался---пакет был установлен с помощью Yum из официальных репозиториев или нет? Что значит список Юм, установленных | грэп кальмары` сказать? Кто-то еще с той же начальной/имя уже утверждал в статье? Какая версия операционной системы macOS вы установили? Упс, я хотел сказать tcp_retries2, к сожалению. tcp_retries1 не то, что вы хотите. И стоимость подсчитать сложно, просто попробуйте увеличить его от того, что она уже есть и посмотреть, если это помогает. @CajunLuke я не знаю, но когда я открыл ссылку от KassymDorsel я просто знал, что это файл Windows, я получил его с ноутбука с Windows ОС. Я думал, что это как CHM-файл может быть открыт в Mac :-/ Я думаю, что ваше недоумение о том, почему я хочу изменить заголовок столбца может быть ответил на мой ответ ниже. Я не хочу, чтобы мои регулярные выражения, чтобы поймать что-нибудь внутри текст файл, а не строку заголовка и мне нужно заголовок как переменной формулировать свои инструкции create. Спасибо за ваш ответ!

У меня есть два файла genelist.txt и data.txt. genelist.txt просто содержит один столбец ~500 генов имена, в то время как data.txt это файл с разделителями табуляции, который содержит ~1000 столбцов (выборок) и ~30 000 строк (ген имена). Общая схема data.txt описанные ниже.

Образец 1 Образец 2 Образец 3 Образец 4 Гена 1.04 1.81 1.92 0.45 Ген B 1.11 1.12 0.92 1.32 Гена C 0.72 0.71 0.85 1.12 Гена D 1.19 1.42 0.13 0.32

Мне нужно, чтобы извлечь все строки (все строки, т. е. все выборки) от data.txt содержащие каждый из ~500 генов имена в genelist.txt и эти строки извлекаются в отдельный файл. Мне сказали, чтобы использовать grep или awk и посмотрел на как это сделать, однако, как простой биолог с мало/нет опыта программирования у меня возникли небольшие неприятности. Было бы возможно, чтобы кто-нибудь объяснил, как это делается, и, надеюсь, предоставить какой-то код для меня, чтобы начать.

Было бы также быть аккуратным, если добыча вернулся только термины, соответствующие всему имени Гена в genelist.txt. Например, если я АБВ123 , но не ABC1234 в genelist.txtя хотел только АБВ123 , чтобы быть извлечены и не ABC1234.

Кроме того, после этого как бы я затем проверить, чтобы увидеть, какие из моих генов genelist.txt не были включены в добыче? (т. е. некоторые гены могут быть неправильно назвали, поэтому мне придется вернуться и снова извлекает их с их альтернативным и/или правильное название).